Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF14O43557 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms