Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA2O43364 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms