Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TO15178 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TO15178 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TO15178 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TO15178 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TO15178 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TO15178 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TO15178 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TO15178 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TO15178 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TO15178 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TO15178 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TO15178 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TO15178 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TO15178 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TO15178 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TO15178 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TO15178 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TO15178 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TO15178 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TO15178 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TO15178 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TO15178 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TO15178 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TO15178 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TO15178 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TO15178 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TO15178 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TO15178 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TO15178 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TO15178 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TO15178 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TO15178 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TO15178 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TO15178 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TO15178 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TO15178 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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