Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNMO15061 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNMO15061 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNMO15061 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNMO15061 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNMO15061 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNMO15061 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNMO15061 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNMO15061 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNMO15061 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNMO15061 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNMO15061 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNMO15061 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNMO15061 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNMO15061 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNMO15061 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNMO15061 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNMO15061 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNMO15061 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNMO15061 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNMO15061 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNMO15061 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNMO15061 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNMO15061 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNMO15061 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNMO15061 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNMO15061 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNMO15061 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNMO15061 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNMO15061 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNMO15061 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNMO15061 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNMO15061 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNMO15061 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNMO15061 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNMO15061 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNMO15061 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNMO15061 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNMO15061 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNMO15061 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNMO15061 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNMO15061 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNMO15061 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNMO15061 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNMO15061 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNMO15061 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNMO15061 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNMO15061 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNMO15061 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNMO15061 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNMO15061 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNMO15061 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
SYNMO15061 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SYNMO15061 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SYNMO15061 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNMO15061 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNMO15061 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNMO15061 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNMO15061 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNMO15061 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNMO15061 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNMO15061 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNMO15061 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNMO15061 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNMO15061 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNMO15061 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNMO15061 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNMO15061 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNMO15061 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNMO15061 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNMO15061 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNMO15061 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNMO15061 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNMO15061 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNMO15061 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNMO15061 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNMO15061 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNMO15061 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNMO15061 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNMO15061 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNMO15061 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNMO15061 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNMO15061 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNMO15061 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNMO15061 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNMO15061 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNMO15061 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNMO15061 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNMO15061 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNMO15061 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNMO15061 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNMO15061 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNMO15061 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNMO15061 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNMO15061 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNMO15061 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNMO15061 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNMO15061 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNMO15061 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNMO15061 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms