Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLGNO14967 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLGNO14967 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLGNO14967 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLGNO14967 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLGNO14967 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLGNO14967 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLGNO14967 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLGNO14967 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLGNO14967 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLGNO14967 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLGNO14967 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CLGNO14967 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLGNO14967 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLGNO14967 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLGNO14967 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLGNO14967 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLGNO14967 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLGNO14967 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLGNO14967 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLGNO14967 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLGNO14967 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLGNO14967 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLGNO14967 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLGNO14967 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLGNO14967 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLGNO14967 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLGNO14967 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLGNO14967 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLGNO14967 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLGNO14967 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLGNO14967 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLGNO14967 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLGNO14967 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLGNO14967 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLGNO14967 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLGNO14967 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLGNO14967 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLGNO14967 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLGNO14967 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms