Protein–RNA interactions for Protein: O14910

LIN7A, Protein lin-7 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN7AO14910 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN7AO14910 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms