Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms