Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms