Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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C4orf47A7E2U8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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