Protein–RNA interactions for Protein: A6NMD2

GOLGA8J, Golgin subfamily A member 8J, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8JA6NMD2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8JA6NMD2 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms