Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms