Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms