Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CFAP69A5D8W1 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms