Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms