Protein–RNA interactions for Protein: U3KQV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQV3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
U3KQV3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U3KQV3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
U3KQV3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
U3KQV3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
U3KQV3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U3KQV3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U3KQV3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
U3KQV3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
U3KQV3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U3KQV3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U3KQV3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
U3KQV3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U3KQV3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
U3KQV3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
U3KQV3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
U3KQV3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
U3KQV3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
U3KQV3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
U3KQV3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
U3KQV3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
U3KQV3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
U3KQV3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
U3KQV3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
U3KQV3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
U3KQV3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
U3KQV3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
U3KQV3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
U3KQV3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
U3KQV3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
U3KQV3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
U3KQV3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
U3KQV3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
U3KQV3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
U3KQV3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
U3KQV3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
U3KQV3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
U3KQV3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
U3KQV3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
U3KQV3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
U3KQV3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
U3KQV3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
U3KQV3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
U3KQV3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
U3KQV3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
U3KQV3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
U3KQV3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
U3KQV3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
U3KQV3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
U3KQV3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
U3KQV3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
U3KQV3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
U3KQV3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
U3KQV3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
U3KQV3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
U3KQV3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
U3KQV3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
U3KQV3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
U3KQV3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
U3KQV3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
U3KQV3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
U3KQV3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
U3KQV3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
U3KQV3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
U3KQV3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
U3KQV3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
U3KQV3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
U3KQV3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
U3KQV3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
U3KQV3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
U3KQV3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
U3KQV3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
U3KQV3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
U3KQV3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U3KQV3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
U3KQV3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
U3KQV3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U3KQV3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
U3KQV3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
U3KQV3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U3KQV3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U3KQV3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
U3KQV3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
U3KQV3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KQV3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KQV3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KQV3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KQV3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KQV3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KQV3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KQV3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KQV3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KQV3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KQV3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KQV3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KQV3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KQV3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KQV3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KQV3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KQV3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms