Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A5

TACC3, Transforming acidic coiled-coil-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TACC3Q9Y6A5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TACC3Q9Y6A5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TACC3Q9Y6A5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TACC3Q9Y6A5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TACC3Q9Y6A5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TACC3Q9Y6A5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TACC3Q9Y6A5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TACC3Q9Y6A5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TACC3Q9Y6A5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TACC3Q9Y6A5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TACC3Q9Y6A5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TACC3Q9Y6A5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TACC3Q9Y6A5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TACC3Q9Y6A5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TACC3Q9Y6A5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TACC3Q9Y6A5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TACC3Q9Y6A5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TACC3Q9Y6A5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TACC3Q9Y6A5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TACC3Q9Y6A5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TACC3Q9Y6A5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TACC3Q9Y6A5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TACC3Q9Y6A5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TACC3Q9Y6A5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TACC3Q9Y6A5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TACC3Q9Y6A5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TACC3Q9Y6A5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TACC3Q9Y6A5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TACC3Q9Y6A5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TACC3Q9Y6A5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TACC3Q9Y6A5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TACC3Q9Y6A5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TACC3Q9Y6A5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TACC3Q9Y6A5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TACC3Q9Y6A5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TACC3Q9Y6A5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TACC3Q9Y6A5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TACC3Q9Y6A5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TACC3Q9Y6A5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TACC3Q9Y6A5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TACC3Q9Y6A5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TACC3Q9Y6A5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TACC3Q9Y6A5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TACC3Q9Y6A5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TACC3Q9Y6A5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TACC3Q9Y6A5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TACC3Q9Y6A5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TACC3Q9Y6A5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TACC3Q9Y6A5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TACC3Q9Y6A5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TACC3Q9Y6A5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TACC3Q9Y6A5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TACC3Q9Y6A5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TACC3Q9Y6A5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TACC3Q9Y6A5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TACC3Q9Y6A5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TACC3Q9Y6A5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TACC3Q9Y6A5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TACC3Q9Y6A5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TACC3Q9Y6A5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TACC3Q9Y6A5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TACC3Q9Y6A5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TACC3Q9Y6A5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TACC3Q9Y6A5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TACC3Q9Y6A5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TACC3Q9Y6A5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TACC3Q9Y6A5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TACC3Q9Y6A5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TACC3Q9Y6A5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TACC3Q9Y6A5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TACC3Q9Y6A5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TACC3Q9Y6A5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TACC3Q9Y6A5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TACC3Q9Y6A5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TACC3Q9Y6A5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TACC3Q9Y6A5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TACC3Q9Y6A5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TACC3Q9Y6A5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TACC3Q9Y6A5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TACC3Q9Y6A5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TACC3Q9Y6A5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TACC3Q9Y6A5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TACC3Q9Y6A5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TACC3Q9Y6A5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TACC3Q9Y6A5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TACC3Q9Y6A5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TACC3Q9Y6A5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TACC3Q9Y6A5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TACC3Q9Y6A5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TACC3Q9Y6A5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TACC3Q9Y6A5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TACC3Q9Y6A5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TACC3Q9Y6A5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TACC3Q9Y6A5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TACC3Q9Y6A5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TACC3Q9Y6A5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TACC3Q9Y6A5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TACC3Q9Y6A5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TACC3Q9Y6A5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TACC3Q9Y6A5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms