Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUBP2Q9Y5Y2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUBP2Q9Y5Y2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUBP2Q9Y5Y2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUBP2Q9Y5Y2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUBP2Q9Y5Y2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUBP2Q9Y5Y2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUBP2Q9Y5Y2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUBP2Q9Y5Y2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUBP2Q9Y5Y2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUBP2Q9Y5Y2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUBP2Q9Y5Y2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUBP2Q9Y5Y2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUBP2Q9Y5Y2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUBP2Q9Y5Y2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUBP2Q9Y5Y2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUBP2Q9Y5Y2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NUBP2Q9Y5Y2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUBP2Q9Y5Y2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUBP2Q9Y5Y2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NUBP2Q9Y5Y2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUBP2Q9Y5Y2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
NUBP2Q9Y5Y2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUBP2Q9Y5Y2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUBP2Q9Y5Y2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms