Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W9

SNX11, Sorting nexin-11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11Q9Y5W9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX11Q9Y5W9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX11Q9Y5W9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX11Q9Y5W9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX11Q9Y5W9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX11Q9Y5W9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX11Q9Y5W9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX11Q9Y5W9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX11Q9Y5W9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX11Q9Y5W9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX11Q9Y5W9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX11Q9Y5W9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX11Q9Y5W9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX11Q9Y5W9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX11Q9Y5W9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX11Q9Y5W9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX11Q9Y5W9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX11Q9Y5W9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX11Q9Y5W9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX11Q9Y5W9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX11Q9Y5W9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX11Q9Y5W9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX11Q9Y5W9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX11Q9Y5W9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX11Q9Y5W9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX11Q9Y5W9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX11Q9Y5W9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX11Q9Y5W9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX11Q9Y5W9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX11Q9Y5W9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX11Q9Y5W9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX11Q9Y5W9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX11Q9Y5W9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX11Q9Y5W9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX11Q9Y5W9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX11Q9Y5W9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX11Q9Y5W9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX11Q9Y5W9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX11Q9Y5W9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX11Q9Y5W9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX11Q9Y5W9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX11Q9Y5W9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX11Q9Y5W9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX11Q9Y5W9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX11Q9Y5W9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX11Q9Y5W9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX11Q9Y5W9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX11Q9Y5W9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX11Q9Y5W9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX11Q9Y5W9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX11Q9Y5W9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX11Q9Y5W9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX11Q9Y5W9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX11Q9Y5W9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX11Q9Y5W9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX11Q9Y5W9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX11Q9Y5W9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX11Q9Y5W9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.7 ms