Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
NRXN3Q9Y4C0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NRXN3Q9Y4C0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NRXN3Q9Y4C0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NRXN3Q9Y4C0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NRXN3Q9Y4C0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NRXN3Q9Y4C0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NRXN3Q9Y4C0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NRXN3Q9Y4C0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NRXN3Q9Y4C0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NRXN3Q9Y4C0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NRXN3Q9Y4C0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NRXN3Q9Y4C0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NRXN3Q9Y4C0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NRXN3Q9Y4C0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NRXN3Q9Y4C0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
NRXN3Q9Y4C0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NRXN3Q9Y4C0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NRXN3Q9Y4C0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NRXN3Q9Y4C0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NRXN3Q9Y4C0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NRXN3Q9Y4C0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NRXN3Q9Y4C0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
NRXN3Q9Y4C0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
NRXN3Q9Y4C0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NRXN3Q9Y4C0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NRXN3Q9Y4C0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NRXN3Q9Y4C0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NRXN3Q9Y4C0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NRXN3Q9Y4C0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NRXN3Q9Y4C0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NRXN3Q9Y4C0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NRXN3Q9Y4C0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NRXN3Q9Y4C0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
NRXN3Q9Y4C0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NRXN3Q9Y4C0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NRXN3Q9Y4C0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NRXN3Q9Y4C0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NRXN3Q9Y4C0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
NRXN3Q9Y4C0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NRXN3Q9Y4C0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NRXN3Q9Y4C0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NRXN3Q9Y4C0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NRXN3Q9Y4C0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NRXN3Q9Y4C0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
NRXN3Q9Y4C0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NRXN3Q9Y4C0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NRXN3Q9Y4C0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NRXN3Q9Y4C0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NRXN3Q9Y4C0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NRXN3Q9Y4C0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NRXN3Q9Y4C0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NRXN3Q9Y4C0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NRXN3Q9Y4C0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NRXN3Q9Y4C0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NRXN3Q9Y4C0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NRXN3Q9Y4C0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NRXN3Q9Y4C0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NRXN3Q9Y4C0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NRXN3Q9Y4C0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NRXN3Q9Y4C0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NRXN3Q9Y4C0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NRXN3Q9Y4C0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NRXN3Q9Y4C0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NRXN3Q9Y4C0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NRXN3Q9Y4C0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NRXN3Q9Y4C0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NRXN3Q9Y4C0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NRXN3Q9Y4C0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NRXN3Q9Y4C0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NRXN3Q9Y4C0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NRXN3Q9Y4C0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NRXN3Q9Y4C0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NRXN3Q9Y4C0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NRXN3Q9Y4C0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
NRXN3Q9Y4C0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NRXN3Q9Y4C0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NRXN3Q9Y4C0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NRXN3Q9Y4C0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
NRXN3Q9Y4C0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NRXN3Q9Y4C0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NRXN3Q9Y4C0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NRXN3Q9Y4C0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NRXN3Q9Y4C0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NRXN3Q9Y4C0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NRXN3Q9Y4C0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NRXN3Q9Y4C0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NRXN3Q9Y4C0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NRXN3Q9Y4C0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NRXN3Q9Y4C0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NRXN3Q9Y4C0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NRXN3Q9Y4C0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
NRXN3Q9Y4C0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
NRXN3Q9Y4C0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NRXN3Q9Y4C0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NRXN3Q9Y4C0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NRXN3Q9Y4C0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NRXN3Q9Y4C0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
NRXN3Q9Y4C0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
NRXN3Q9Y4C0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms