Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3V2

RWDD3, RWD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD3Q9Y3V2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RWDD3Q9Y3V2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RWDD3Q9Y3V2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RWDD3Q9Y3V2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RWDD3Q9Y3V2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RWDD3Q9Y3V2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RWDD3Q9Y3V2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RWDD3Q9Y3V2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RWDD3Q9Y3V2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RWDD3Q9Y3V2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RWDD3Q9Y3V2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RWDD3Q9Y3V2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RWDD3Q9Y3V2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RWDD3Q9Y3V2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RWDD3Q9Y3V2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RWDD3Q9Y3V2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RWDD3Q9Y3V2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RWDD3Q9Y3V2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RWDD3Q9Y3V2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RWDD3Q9Y3V2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RWDD3Q9Y3V2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RWDD3Q9Y3V2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RWDD3Q9Y3V2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RWDD3Q9Y3V2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RWDD3Q9Y3V2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RWDD3Q9Y3V2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RWDD3Q9Y3V2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RWDD3Q9Y3V2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RWDD3Q9Y3V2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RWDD3Q9Y3V2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RWDD3Q9Y3V2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RWDD3Q9Y3V2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RWDD3Q9Y3V2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RWDD3Q9Y3V2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RWDD3Q9Y3V2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RWDD3Q9Y3V2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RWDD3Q9Y3V2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RWDD3Q9Y3V2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RWDD3Q9Y3V2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RWDD3Q9Y3V2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RWDD3Q9Y3V2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RWDD3Q9Y3V2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RWDD3Q9Y3V2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RWDD3Q9Y3V2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RWDD3Q9Y3V2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RWDD3Q9Y3V2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RWDD3Q9Y3V2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RWDD3Q9Y3V2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RWDD3Q9Y3V2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RWDD3Q9Y3V2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RWDD3Q9Y3V2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RWDD3Q9Y3V2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RWDD3Q9Y3V2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RWDD3Q9Y3V2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RWDD3Q9Y3V2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RWDD3Q9Y3V2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RWDD3Q9Y3V2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms