Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HCN4Q9Y3Q4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HCN4Q9Y3Q4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HCN4Q9Y3Q4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HCN4Q9Y3Q4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HCN4Q9Y3Q4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HCN4Q9Y3Q4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HCN4Q9Y3Q4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HCN4Q9Y3Q4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HCN4Q9Y3Q4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HCN4Q9Y3Q4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HCN4Q9Y3Q4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HCN4Q9Y3Q4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HCN4Q9Y3Q4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HCN4Q9Y3Q4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HCN4Q9Y3Q4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HCN4Q9Y3Q4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HCN4Q9Y3Q4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HCN4Q9Y3Q4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HCN4Q9Y3Q4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HCN4Q9Y3Q4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HCN4Q9Y3Q4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HCN4Q9Y3Q4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HCN4Q9Y3Q4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HCN4Q9Y3Q4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HCN4Q9Y3Q4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HCN4Q9Y3Q4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HCN4Q9Y3Q4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HCN4Q9Y3Q4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HCN4Q9Y3Q4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HCN4Q9Y3Q4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HCN4Q9Y3Q4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HCN4Q9Y3Q4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HCN4Q9Y3Q4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
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