Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HDGFL3Q9Y3E1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms