Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMED7Q9Y3B3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms