Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAB39Q9Y376 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAB39Q9Y376 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms