Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHKBQ9Y259 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHKBQ9Y259 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHKBQ9Y259 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHKBQ9Y259 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHKBQ9Y259 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHKBQ9Y259 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHKBQ9Y259 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHKBQ9Y259 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHKBQ9Y259 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHKBQ9Y259 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHKBQ9Y259 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CHKBQ9Y259 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHKBQ9Y259 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHKBQ9Y259 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CHKBQ9Y259 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHKBQ9Y259 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHKBQ9Y259 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHKBQ9Y259 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHKBQ9Y259 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHKBQ9Y259 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHKBQ9Y259 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHKBQ9Y259 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHKBQ9Y259 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHKBQ9Y259 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHKBQ9Y259 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHKBQ9Y259 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHKBQ9Y259 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHKBQ9Y259 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHKBQ9Y259 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHKBQ9Y259 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHKBQ9Y259 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHKBQ9Y259 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms