Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y234

LIPT1, Lipoyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT1Q9Y234 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LIPT1Q9Y234 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LIPT1Q9Y234 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LIPT1Q9Y234 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LIPT1Q9Y234 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LIPT1Q9Y234 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LIPT1Q9Y234 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LIPT1Q9Y234 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LIPT1Q9Y234 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LIPT1Q9Y234 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LIPT1Q9Y234 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LIPT1Q9Y234 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LIPT1Q9Y234 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LIPT1Q9Y234 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LIPT1Q9Y234 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LIPT1Q9Y234 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LIPT1Q9Y234 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LIPT1Q9Y234 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LIPT1Q9Y234 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LIPT1Q9Y234 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LIPT1Q9Y234 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LIPT1Q9Y234 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LIPT1Q9Y234 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LIPT1Q9Y234 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LIPT1Q9Y234 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LIPT1Q9Y234 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LIPT1Q9Y234 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LIPT1Q9Y234 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LIPT1Q9Y234 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LIPT1Q9Y234 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LIPT1Q9Y234 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LIPT1Q9Y234 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LIPT1Q9Y234 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LIPT1Q9Y234 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LIPT1Q9Y234 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LIPT1Q9Y234 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LIPT1Q9Y234 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LIPT1Q9Y234 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LIPT1Q9Y234 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIPT1Q9Y234 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms