Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTN6Q9UQ52 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNTN6Q9UQ52 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNTN6Q9UQ52 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTN6Q9UQ52 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTN6Q9UQ52 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTN6Q9UQ52 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTN6Q9UQ52 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTN6Q9UQ52 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTN6Q9UQ52 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTN6Q9UQ52 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTN6Q9UQ52 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTN6Q9UQ52 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTN6Q9UQ52 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms