Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMG5Q9UPR3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMG5Q9UPR3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMG5Q9UPR3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms