Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX6Q9UPM6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX6Q9UPM6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms