Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPE1

SRPK3, SRSF protein kinase 3, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK3Q9UPE1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPK3Q9UPE1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPK3Q9UPE1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
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