Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
L1RE1Q9UN81 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
L1RE1Q9UN81 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms