Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL4

PLXNB3, Plexin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB3Q9ULL4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLXNB3Q9ULL4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLXNB3Q9ULL4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PLXNB3Q9ULL4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PLXNB3Q9ULL4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PLXNB3Q9ULL4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PLXNB3Q9ULL4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXNB3Q9ULL4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXNB3Q9ULL4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXNB3Q9ULL4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXNB3Q9ULL4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXNB3Q9ULL4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXNB3Q9ULL4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXNB3Q9ULL4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXNB3Q9ULL4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLXNB3Q9ULL4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLXNB3Q9ULL4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLXNB3Q9ULL4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLXNB3Q9ULL4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLXNB3Q9ULL4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLXNB3Q9ULL4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLXNB3Q9ULL4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLXNB3Q9ULL4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLXNB3Q9ULL4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLXNB3Q9ULL4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXNB3Q9ULL4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLXNB3Q9ULL4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms