Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG4

SLC13A4, Solute carrier family 13 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A4Q9UKG4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC13A4Q9UKG4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC13A4Q9UKG4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms