Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGA2Q9UJY4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGA2Q9UJY4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GGA2Q9UJY4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms