Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT1

TUBD1, Tubulin delta chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBD1Q9UJT1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBD1Q9UJT1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms