Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA2

CRLS1, Cardiolipin synthase (CMP-forming), humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLS1Q9UJA2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRLS1Q9UJA2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRLS1Q9UJA2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CRLS1Q9UJA2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRLS1Q9UJA2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRLS1Q9UJA2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRLS1Q9UJA2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRLS1Q9UJA2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRLS1Q9UJA2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRLS1Q9UJA2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRLS1Q9UJA2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRLS1Q9UJA2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRLS1Q9UJA2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRLS1Q9UJA2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRLS1Q9UJA2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CRLS1Q9UJA2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRLS1Q9UJA2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRLS1Q9UJA2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRLS1Q9UJA2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRLS1Q9UJA2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRLS1Q9UJA2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRLS1Q9UJA2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRLS1Q9UJA2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRLS1Q9UJA2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRLS1Q9UJA2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CRLS1Q9UJA2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRLS1Q9UJA2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRLS1Q9UJA2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRLS1Q9UJA2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRLS1Q9UJA2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRLS1Q9UJA2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRLS1Q9UJA2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRLS1Q9UJA2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRLS1Q9UJA2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRLS1Q9UJA2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CRLS1Q9UJA2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRLS1Q9UJA2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms