Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSRAQ9UJ68 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSRAQ9UJ68 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSRAQ9UJ68 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSRAQ9UJ68 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSRAQ9UJ68 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSRAQ9UJ68 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSRAQ9UJ68 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MSRAQ9UJ68 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MSRAQ9UJ68 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MSRAQ9UJ68 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MSRAQ9UJ68 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSRAQ9UJ68 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSRAQ9UJ68 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSRAQ9UJ68 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSRAQ9UJ68 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSRAQ9UJ68 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSRAQ9UJ68 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSRAQ9UJ68 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSRAQ9UJ68 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSRAQ9UJ68 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSRAQ9UJ68 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSRAQ9UJ68 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSRAQ9UJ68 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSRAQ9UJ68 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSRAQ9UJ68 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSRAQ9UJ68 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSRAQ9UJ68 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSRAQ9UJ68 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MSRAQ9UJ68 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MSRAQ9UJ68 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MSRAQ9UJ68 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSRAQ9UJ68 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSRAQ9UJ68 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSRAQ9UJ68 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSRAQ9UJ68 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSRAQ9UJ68 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSRAQ9UJ68 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MSRAQ9UJ68 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MSRAQ9UJ68 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSRAQ9UJ68 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MSRAQ9UJ68 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSRAQ9UJ68 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSRAQ9UJ68 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSRAQ9UJ68 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MSRAQ9UJ68 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSRAQ9UJ68 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MSRAQ9UJ68 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MSRAQ9UJ68 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MSRAQ9UJ68 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MSRAQ9UJ68 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms