Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIV1

CNOT7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT7Q9UIV1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNOT7Q9UIV1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNOT7Q9UIV1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CNOT7Q9UIV1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CNOT7Q9UIV1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNOT7Q9UIV1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNOT7Q9UIV1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNOT7Q9UIV1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNOT7Q9UIV1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNOT7Q9UIV1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNOT7Q9UIV1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNOT7Q9UIV1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNOT7Q9UIV1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNOT7Q9UIV1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNOT7Q9UIV1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNOT7Q9UIV1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNOT7Q9UIV1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNOT7Q9UIV1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNOT7Q9UIV1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNOT7Q9UIV1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNOT7Q9UIV1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNOT7Q9UIV1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNOT7Q9UIV1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CNOT7Q9UIV1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNOT7Q9UIV1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNOT7Q9UIV1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNOT7Q9UIV1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNOT7Q9UIV1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CNOT7Q9UIV1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CNOT7Q9UIV1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNOT7Q9UIV1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNOT7Q9UIV1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNOT7Q9UIV1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CNOT7Q9UIV1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CNOT7Q9UIV1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CNOT7Q9UIV1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNOT7Q9UIV1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNOT7Q9UIV1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNOT7Q9UIV1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNOT7Q9UIV1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNOT7Q9UIV1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNOT7Q9UIV1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNOT7Q9UIV1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNOT7Q9UIV1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNOT7Q9UIV1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNOT7Q9UIV1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNOT7Q9UIV1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CNOT7Q9UIV1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNOT7Q9UIV1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNOT7Q9UIV1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNOT7Q9UIV1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNOT7Q9UIV1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNOT7Q9UIV1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CNOT7Q9UIV1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNOT7Q9UIV1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNOT7Q9UIV1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNOT7Q9UIV1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNOT7Q9UIV1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNOT7Q9UIV1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CNOT7Q9UIV1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNOT7Q9UIV1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNOT7Q9UIV1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNOT7Q9UIV1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNOT7Q9UIV1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNOT7Q9UIV1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNOT7Q9UIV1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNOT7Q9UIV1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNOT7Q9UIV1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNOT7Q9UIV1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNOT7Q9UIV1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNOT7Q9UIV1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNOT7Q9UIV1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNOT7Q9UIV1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNOT7Q9UIV1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNOT7Q9UIV1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNOT7Q9UIV1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CNOT7Q9UIV1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNOT7Q9UIV1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CNOT7Q9UIV1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNOT7Q9UIV1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CNOT7Q9UIV1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNOT7Q9UIV1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNOT7Q9UIV1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNOT7Q9UIV1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNOT7Q9UIV1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNOT7Q9UIV1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNOT7Q9UIV1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNOT7Q9UIV1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CNOT7Q9UIV1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNOT7Q9UIV1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNOT7Q9UIV1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNOT7Q9UIV1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNOT7Q9UIV1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNOT7Q9UIV1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNOT7Q9UIV1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNOT7Q9UIV1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNOT7Q9UIV1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNOT7Q9UIV1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNOT7Q9UIV1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNOT7Q9UIV1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
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