Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SCN11AQ9UI33 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SCN11AQ9UI33 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCN11AQ9UI33 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCN11AQ9UI33 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCN11AQ9UI33 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
SCN11AQ9UI33 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCN11AQ9UI33 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCN11AQ9UI33 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCN11AQ9UI33 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCN11AQ9UI33 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCN11AQ9UI33 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCN11AQ9UI33 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCN11AQ9UI33 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCN11AQ9UI33 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
SCN11AQ9UI33 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCN11AQ9UI33 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCN11AQ9UI33 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCN11AQ9UI33 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCN11AQ9UI33 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCN11AQ9UI33 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCN11AQ9UI33 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCN11AQ9UI33 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCN11AQ9UI33 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
SCN11AQ9UI33 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCN11AQ9UI33 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCN11AQ9UI33 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
SCN11AQ9UI33 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
SCN11AQ9UI33 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
SCN11AQ9UI33 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SCN11AQ9UI33 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SCN11AQ9UI33 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SCN11AQ9UI33 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SCN11AQ9UI33 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SCN11AQ9UI33 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCN11AQ9UI33 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCN11AQ9UI33 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCN11AQ9UI33 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCN11AQ9UI33 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCN11AQ9UI33 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SCN11AQ9UI33 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SCN11AQ9UI33 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SCN11AQ9UI33 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SCN11AQ9UI33 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SCN11AQ9UI33 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SCN11AQ9UI33 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SCN11AQ9UI33 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SCN11AQ9UI33 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SCN11AQ9UI33 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SCN11AQ9UI33 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SCN11AQ9UI33 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SCN11AQ9UI33 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SCN11AQ9UI33 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SCN11AQ9UI33 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
SCN11AQ9UI33 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SCN11AQ9UI33 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SCN11AQ9UI33 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SCN11AQ9UI33 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SCN11AQ9UI33 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
SCN11AQ9UI33 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SCN11AQ9UI33 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SCN11AQ9UI33 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SCN11AQ9UI33 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SCN11AQ9UI33 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SCN11AQ9UI33 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SCN11AQ9UI33 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SCN11AQ9UI33 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SCN11AQ9UI33 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SCN11AQ9UI33 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SCN11AQ9UI33 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SCN11AQ9UI33 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
SCN11AQ9UI33 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SCN11AQ9UI33 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SCN11AQ9UI33 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SCN11AQ9UI33 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SCN11AQ9UI33 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SCN11AQ9UI33 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SCN11AQ9UI33 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SCN11AQ9UI33 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SCN11AQ9UI33 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SCN11AQ9UI33 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SCN11AQ9UI33 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SCN11AQ9UI33 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SCN11AQ9UI33 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
SCN11AQ9UI33 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SCN11AQ9UI33 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
SCN11AQ9UI33 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SCN11AQ9UI33 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SCN11AQ9UI33 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SCN11AQ9UI33 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SCN11AQ9UI33 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SCN11AQ9UI33 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SCN11AQ9UI33 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SCN11AQ9UI33 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SCN11AQ9UI33 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
SCN11AQ9UI33 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SCN11AQ9UI33 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SCN11AQ9UI33 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SCN11AQ9UI33 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SCN11AQ9UI33 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms