Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PUF60Q9UHX1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PUF60Q9UHX1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PUF60Q9UHX1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PUF60Q9UHX1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PUF60Q9UHX1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PUF60Q9UHX1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PUF60Q9UHX1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PUF60Q9UHX1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms