Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAJB4Q9UDY4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAJB4Q9UDY4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAJB4Q9UDY4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAJB4Q9UDY4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAJB4Q9UDY4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAJB4Q9UDY4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAJB4Q9UDY4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAJB4Q9UDY4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAJB4Q9UDY4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAJB4Q9UDY4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNAJB4Q9UDY4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNAJB4Q9UDY4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNAJB4Q9UDY4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNAJB4Q9UDY4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNAJB4Q9UDY4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAJB4Q9UDY4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAJB4Q9UDY4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAJB4Q9UDY4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAJB4Q9UDY4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAJB4Q9UDY4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAJB4Q9UDY4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAJB4Q9UDY4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAJB4Q9UDY4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAJB4Q9UDY4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAJB4Q9UDY4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAJB4Q9UDY4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAJB4Q9UDY4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAJB4Q9UDY4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAJB4Q9UDY4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAJB4Q9UDY4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAJB4Q9UDY4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAJB4Q9UDY4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAJB4Q9UDY4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAJB4Q9UDY4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNAJB4Q9UDY4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DNAJB4Q9UDY4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DNAJB4Q9UDY4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DNAJB4Q9UDY4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAJB4Q9UDY4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAJB4Q9UDY4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAJB4Q9UDY4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAJB4Q9UDY4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAJB4Q9UDY4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAJB4Q9UDY4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAJB4Q9UDY4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNAJB4Q9UDY4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNAJB4Q9UDY4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNAJB4Q9UDY4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNAJB4Q9UDY4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNAJB4Q9UDY4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms