Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN6

TNFRSF10D, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10DQ9UBN6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFRSF10DQ9UBN6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF10DQ9UBN6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF10DQ9UBN6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF10DQ9UBN6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF10DQ9UBN6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF10DQ9UBN6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF10DQ9UBN6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF10DQ9UBN6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF10DQ9UBN6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF10DQ9UBN6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF10DQ9UBN6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF10DQ9UBN6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF10DQ9UBN6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF10DQ9UBN6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF10DQ9UBN6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF10DQ9UBN6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF10DQ9UBN6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF10DQ9UBN6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF10DQ9UBN6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF10DQ9UBN6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF10DQ9UBN6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF10DQ9UBN6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF10DQ9UBN6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF10DQ9UBN6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF10DQ9UBN6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF10DQ9UBN6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF10DQ9UBN6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFRSF10DQ9UBN6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF10DQ9UBN6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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