Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL13Q9P2N7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
KLHL13Q9P2N7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms