Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2I0

CPSF2, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF2Q9P2I0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPSF2Q9P2I0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPSF2Q9P2I0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPSF2Q9P2I0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms