Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.72■■■■■ 5.39
CCDC180Q9P1Z9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC48.72■■■■■ 5.39
CCDC180Q9P1Z9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC48.72■■■■■ 5.39
CCDC180Q9P1Z9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC48.71■■■■■ 5.39
CCDC180Q9P1Z9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC48.7■■■■■ 5.39
CCDC180Q9P1Z9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.7■■■■■ 5.39
CCDC180Q9P1Z9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC48.7■■■■■ 5.39
CCDC180Q9P1Z9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC48.7■■■■■ 5.39
CCDC180Q9P1Z9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC48.7■■■■■ 5.39
CCDC180Q9P1Z9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.69■■■■■ 5.39
CCDC180Q9P1Z9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.69■■■■■ 5.39
CCDC180Q9P1Z9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.69■■■■■ 5.39
CCDC180Q9P1Z9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.69■■■■■ 5.38
CCDC180Q9P1Z9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC48.69■■■■■ 5.38
CCDC180Q9P1Z9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC48.69■■■■■ 5.38
CCDC180Q9P1Z9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC48.68■■■■■ 5.38
CCDC180Q9P1Z9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC48.68■■■■■ 5.38
CCDC180Q9P1Z9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC48.67■■■■■ 5.38
CCDC180Q9P1Z9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.67■■■■■ 5.38
CCDC180Q9P1Z9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.67■■■■■ 5.38
CCDC180Q9P1Z9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC48.66■■■■■ 5.38
CCDC180Q9P1Z9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC48.66■■■■■ 5.38
CCDC180Q9P1Z9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48.65■■■■■ 5.38
CCDC180Q9P1Z9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC48.65■■■■■ 5.38
CCDC180Q9P1Z9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.63■■■■■ 5.38
CCDC180Q9P1Z9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC48.63■■■■■ 5.38
CCDC180Q9P1Z9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC48.63■■■■■ 5.38
CCDC180Q9P1Z9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.63■■■■■ 5.37
CCDC180Q9P1Z9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.63■■■■■ 5.37
CCDC180Q9P1Z9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC48.62■■■■■ 5.37
CCDC180Q9P1Z9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC48.62■■■■■ 5.37
CCDC180Q9P1Z9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC48.62■■■■■ 5.37
CCDC180Q9P1Z9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC48.61■■■■■ 5.37
CCDC180Q9P1Z9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.61■■■■■ 5.37
CCDC180Q9P1Z9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC48.61■■■■■ 5.37
CCDC180Q9P1Z9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC48.61■■■■■ 5.37
CCDC180Q9P1Z9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC48.61■■■■■ 5.37
CCDC180Q9P1Z9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC48.6■■■■■ 5.37
CCDC180Q9P1Z9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC48.6■■■■■ 5.37
CCDC180Q9P1Z9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC48.6■■■■■ 5.37
CCDC180Q9P1Z9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC48.6■■■■■ 5.37
CCDC180Q9P1Z9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC48.59■■■■■ 5.37
CCDC180Q9P1Z9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.58■■■■■ 5.37
CCDC180Q9P1Z9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.58■■■■■ 5.37
CCDC180Q9P1Z9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.58■■■■■ 5.37
CCDC180Q9P1Z9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC48.58■■■■■ 5.37
CCDC180Q9P1Z9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC48.58■■■■■ 5.37
CCDC180Q9P1Z9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC48.57■■■■■ 5.37
CCDC180Q9P1Z9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.57■■■■■ 5.37
CCDC180Q9P1Z9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.57■■■■■ 5.37
CCDC180Q9P1Z9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.56■■■■■ 5.36
CCDC180Q9P1Z9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC48.56■■■■■ 5.36
CCDC180Q9P1Z9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.55■■■■■ 5.36
CCDC180Q9P1Z9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.55■■■■■ 5.36
CCDC180Q9P1Z9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC48.55■■■■■ 5.36
CCDC180Q9P1Z9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC48.55■■■■■ 5.36
CCDC180Q9P1Z9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.55■■■■■ 5.36
CCDC180Q9P1Z9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC48.55■■■■■ 5.36
CCDC180Q9P1Z9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC48.55■■■■■ 5.36
CCDC180Q9P1Z9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC48.54■■■■■ 5.36
CCDC180Q9P1Z9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC48.54■■■■■ 5.36
CCDC180Q9P1Z9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.54■■■■■ 5.36
CCDC180Q9P1Z9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.54■■■■■ 5.36
CCDC180Q9P1Z9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.54■■■■■ 5.36
CCDC180Q9P1Z9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC48.54■■■■■ 5.36
CCDC180Q9P1Z9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC48.54■■■■■ 5.36
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.54■■■■■ 5.36
CCDC180Q9P1Z9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC48.54■■■■■ 5.36
CCDC180Q9P1Z9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC48.54■■■■■ 5.36
CCDC180Q9P1Z9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.54■■■■■ 5.36
CCDC180Q9P1Z9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC48.54■■■■■ 5.36
CCDC180Q9P1Z9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC48.53■■■■■ 5.36
CCDC180Q9P1Z9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC48.52■■■■■ 5.36
CCDC180Q9P1Z9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.52■■■■■ 5.36
CCDC180Q9P1Z9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC48.52■■■■■ 5.36
CCDC180Q9P1Z9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.51■■■■■ 5.36
CCDC180Q9P1Z9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.5■■■■■ 5.36
CCDC180Q9P1Z9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC48.5■■■■■ 5.36
CCDC180Q9P1Z9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC48.5■■■■■ 5.35
CCDC180Q9P1Z9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC48.5■■■■■ 5.35
CCDC180Q9P1Z9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC48.49■■■■■ 5.35
CCDC180Q9P1Z9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.49■■■■■ 5.35
CCDC180Q9P1Z9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.49■■■■■ 5.35
CCDC180Q9P1Z9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.49■■■■■ 5.35
CCDC180Q9P1Z9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC48.48■■■■■ 5.35
CCDC180Q9P1Z9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC48.48■■■■■ 5.35
CCDC180Q9P1Z9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC48.48■■■■■ 5.35
CCDC180Q9P1Z9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48.47■■■■■ 5.35
CCDC180Q9P1Z9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC48.46■■■■■ 5.35
CCDC180Q9P1Z9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.45■■■■■ 5.35
CCDC180Q9P1Z9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC48.45■■■■■ 5.35
CCDC180Q9P1Z9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.45■■■■■ 5.35
CCDC180Q9P1Z9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.45■■■■■ 5.35
CCDC180Q9P1Z9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.45■■■■■ 5.35
CCDC180Q9P1Z9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC48.44■■■■■ 5.35
CCDC180Q9P1Z9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.44■■■■■ 5.35
CCDC180Q9P1Z9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC48.44■■■■■ 5.35
CCDC180Q9P1Z9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.44■■■■■ 5.34
CCDC180Q9P1Z9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC48.43■■■■■ 5.34
CCDC180Q9P1Z9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC48.43■■■■■ 5.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms