Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1F3

ABRACL, Costars family protein ABRACL, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRACLQ9P1F3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABRACLQ9P1F3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABRACLQ9P1F3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms