Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCMF1Q9P0J7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms