Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLDND1Q9NY35 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLDND1Q9NY35 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDND1Q9NY35 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDND1Q9NY35 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDND1Q9NY35 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDND1Q9NY35 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDND1Q9NY35 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDND1Q9NY35 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDND1Q9NY35 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDND1Q9NY35 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDND1Q9NY35 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDND1Q9NY35 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDND1Q9NY35 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDND1Q9NY35 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDND1Q9NY35 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDND1Q9NY35 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDND1Q9NY35 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDND1Q9NY35 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDND1Q9NY35 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDND1Q9NY35 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDND1Q9NY35 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDND1Q9NY35 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDND1Q9NY35 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDND1Q9NY35 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDND1Q9NY35 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDND1Q9NY35 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDND1Q9NY35 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDND1Q9NY35 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDND1Q9NY35 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CLDND1Q9NY35 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLDND1Q9NY35 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLDND1Q9NY35 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLDND1Q9NY35 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CLDND1Q9NY35 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLDND1Q9NY35 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDND1Q9NY35 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDND1Q9NY35 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDND1Q9NY35 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDND1Q9NY35 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDND1Q9NY35 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDND1Q9NY35 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDND1Q9NY35 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDND1Q9NY35 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDND1Q9NY35 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDND1Q9NY35 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDND1Q9NY35 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDND1Q9NY35 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDND1Q9NY35 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDND1Q9NY35 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDND1Q9NY35 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDND1Q9NY35 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDND1Q9NY35 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDND1Q9NY35 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDND1Q9NY35 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDND1Q9NY35 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDND1Q9NY35 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDND1Q9NY35 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDND1Q9NY35 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDND1Q9NY35 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDND1Q9NY35 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDND1Q9NY35 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDND1Q9NY35 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDND1Q9NY35 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDND1Q9NY35 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDND1Q9NY35 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDND1Q9NY35 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDND1Q9NY35 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDND1Q9NY35 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLDND1Q9NY35 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDND1Q9NY35 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDND1Q9NY35 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDND1Q9NY35 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDND1Q9NY35 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDND1Q9NY35 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDND1Q9NY35 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDND1Q9NY35 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDND1Q9NY35 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDND1Q9NY35 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDND1Q9NY35 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDND1Q9NY35 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDND1Q9NY35 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDND1Q9NY35 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDND1Q9NY35 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDND1Q9NY35 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDND1Q9NY35 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDND1Q9NY35 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDND1Q9NY35 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDND1Q9NY35 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDND1Q9NY35 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDND1Q9NY35 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDND1Q9NY35 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDND1Q9NY35 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDND1Q9NY35 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDND1Q9NY35 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDND1Q9NY35 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDND1Q9NY35 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDND1Q9NY35 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDND1Q9NY35 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDND1Q9NY35 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms