Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
THUMPD1Q9NXG2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
THUMPD1Q9NXG2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
THUMPD1Q9NXG2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
THUMPD1Q9NXG2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
THUMPD1Q9NXG2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
THUMPD1Q9NXG2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
THUMPD1Q9NXG2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
THUMPD1Q9NXG2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
THUMPD1Q9NXG2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
THUMPD1Q9NXG2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
THUMPD1Q9NXG2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
THUMPD1Q9NXG2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
THUMPD1Q9NXG2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
THUMPD1Q9NXG2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
THUMPD1Q9NXG2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
THUMPD1Q9NXG2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
THUMPD1Q9NXG2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
THUMPD1Q9NXG2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
THUMPD1Q9NXG2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
THUMPD1Q9NXG2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
THUMPD1Q9NXG2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
THUMPD1Q9NXG2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
THUMPD1Q9NXG2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
THUMPD1Q9NXG2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
THUMPD1Q9NXG2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
THUMPD1Q9NXG2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
THUMPD1Q9NXG2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
THUMPD1Q9NXG2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
THUMPD1Q9NXG2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
THUMPD1Q9NXG2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
THUMPD1Q9NXG2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
THUMPD1Q9NXG2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
THUMPD1Q9NXG2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
THUMPD1Q9NXG2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
THUMPD1Q9NXG2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
THUMPD1Q9NXG2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
THUMPD1Q9NXG2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
THUMPD1Q9NXG2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
THUMPD1Q9NXG2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
THUMPD1Q9NXG2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
THUMPD1Q9NXG2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms