Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW7

C2orf42, Uncharacterized protein C2orf42, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf42Q9NWW7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C2orf42Q9NWW7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C2orf42Q9NWW7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms